Este órgano tiene como objetivo diseñar y supervisar la formación musical de los 180 alumnos matriculados en el programa musical. 

El equipo está integrado por académicos profesionales de la música reconocidos en Honduras, Estados Unidos y Europa: Denissa Rivas, Josué Castro, Junior Cortés, Raúl Munguía y Vanessa Genis. Conjuntamente con el equipo operativo Walter Erazo, Elvis Vasquez y Lizandro Alvarez velan por que el proceso educativo se realice con altos niveles de calidad. La dirección del Consejo Académico está bajo la responsabilidad de María Gabriela Delgado-Bertrand.

Un equipo sólido garantiza la calidad de la enseñanza musical de todos los alumnos de Taulabé y San José de Comayagua.